Microbial Kinetics Lab

Proyecto independiente para enseñanza de cinética microbiana en navegador usando Pyodide.

Enfoque

Esta versión no replica el proyecto original de BioReact-Lite. Se rediseñó con un objetivo docente distinto:

• Cultivo batch, no quimiostato.
• Sin plano de fases.
• Sin Jacobiana ni análisis de estabilidad local.
• Controles continuos para explorar sensibilidad paramétrica.
• Python ejecutándose en el navegador con Pyodide.

Modelo

La app mantiene operación en lote y permite seleccionar distintas ecuaciones de crecimiento:

• Monod: mu(S) = mu_max * S / (Ks + S)
• Haldane / inhibición por sustrato: mu(S) = mu_max * S / (Ks + S + S^2 / Ki)
• Moser: mu(S) = mu_max * S^n / (Ks + S^n)

Además:

• dX/dt = (mu - kd) * X
• dS/dt = -(mu * X) / Yxs

La integración numérica usa RK4.

Los parámetros opcionales se desbloquean según el modelo activo:

• Ki para inhibición por sustrato
• n para Moser

Estructura

• index.html: interfaz docente
• styles.css: identidad visual
• app.js: interacción y gráficas con Plotly
• simulator.py: motor numérico ejecutado por Pyodide

GitHub Pages

Con GitHub Pages configurado como Deploy from a branch sobre main, la app queda servida directamente desde:

https://ebalderasr.github.io/MicrobialKineticsLab/

La app es estática y usa rutas relativas, así que no requiere backend para funcionar en Pages.

Ejecución local

Como el navegador bloquea fetch() desde file://, sirve el directorio con un servidor simple:

python3 -m http.server 8000

Luego abre http://localhost:8000.

Siguiente iteración sugerida

• Añadir comparación entre dos escenarios en paralelo.
• Incorporar modo batch vs fed-batch.
• Agregar panel con preguntas guiadas para clase.