Beta atoms based molecular generation
- demo_gen_progress.ipynb 中展示配体分子周围的beta原子，和作为训练样本的生成过程
- 配体分子周围的beta原子：绿色游离的是挑选过的、至少是一个配体原子的最近邻的beta原子
- 生成过程：按照离配体质心的距离，从内到外的确定性的顺序，每一步优先选择未focus过的、离质心最近的beta原子，生成该beta原子周围的所有配体原子之后，再focus下一个beta原子；生成的步数是 #配体原子数 - 1
wxx07/BetaGen
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